坪単価はあくまで建物の本体価格を面積で割った数字です。
敷地の条件によって異なる費用である別途工事費や諸費用は、坪単価には含まれていないのが一般的です。

たとえば水道の引込みや浄化槽の設置などの屋外給排水工事費や空調設備費（エアコン）、外構（庭やガレージ）や地盤改良費など、本体工事費以外の別途工事費用がどこまで含まれているのか確認することが重要です。
また、ローンの手数料や税金、火災保険、登記費用、地鎮祭費用、上棟式費用などの諸費用も本体工事費とは別に必要なお金となります。

坪単価の算出に使われる「本体価格」にどこまでが含まれているのか？

どこまでを本体価格に含むのかという明確な基準は決まっていないので、建築会社によって大きな差が出るところです。
単純に坪単価のみで比較してしまうと、後で思いもやらない追加が発生する場合もあります。
総費用でいくらかかるかを意識しながら資金計画を考えましょう。